企业在新三板（全国中小企业股份转让系统）上市的主要流程包括以下几个步骤：
改制为股份有限公司
企业首先需要将有限责任公司改制为股份有限公司。这一过程通常涉及将有限公司以股改基准日经审计的净资产值整体折股变更为股份公司。
签订推荐挂牌报价转让协议
企业需要与主办券商签订推荐挂牌报价转让协议，明确双方的权利和义务。
尽职调查
主办券商将对企业进行尽职调查，包括财务、法律、业务等方面的全面审查，并编制推荐挂牌备案文件。
申请股份报价转让试点企业资格
企业需要向相关主管机关申请股份报价转让试点企业资格。
备案文件报送与审查
主办券商将尽职调查完成后形成的备案文件报送至中国证券业协会进行审查。协会将对文件进行审查，并在无异议的情况下出具备案确认函。
审核与批准
全国股份转让系统公司将对企业的申请进行审核，并根据审核结果决定是否批准企业上市。审核通过后，企业将获得挂牌许可。
挂牌交易
审核通过后，企业可以正式在新三板挂牌上市，并进行股权或债权的交易。
后续融资
企业挂牌后可以通过定向增发、股权质押贷款或发行中小企业私募债等形式进行融资，以解决资金难题。
整个流程的时间长度可能因企业具体情况和市场环境的变化而有所不同，但根据现有的数据，整个过程一般需要6到9个月左右。
建议在准备新三板上市的过程中，企业应提前做好充分的准备，包括财务梳理、股权结构改革、资料准备和合规性审核，以确保顺利通过新三板上市流程。