员工自动离职后，企业应采取以下措施：
发送限期返岗通知书
企业应首先向员工发送《限期返岗通知书》，要求员工在限定日期内返回工作岗位。
如果员工未按要求返岗，企业应开始计算旷工天数，并在达到可以解除劳动合同的天数后，发送《解除劳动合同通知书》。
解除劳动合同程序
解除劳动合同前，企业应选择适当的方式送达《解除劳动合同通知书》，如直接送达、EMS邮寄或报纸公告等，确保有未送达的凭据。
如果员工未回应，企业可以以旷工理由辞退，并遵循相关法律规定和内部规章制度。
证据收集与保留
员工应收集并保存与劳动关系相关的证据，如劳动合同、工资条、奖金、绩效、提成、年假、报销款等，以备后续仲裁或法律程序使用。
员工应继续正常出勤，避免因旷工等行为给公司留下合理合法辞退的理由。
应对公司单方面措施
如果公司要求员工自离，员工应明确拒绝，并继续正常出勤，不迟到、不早退、不旷工。
如果公司取消员工打卡权限，员工可以使用水印相机APP记录出勤情况，并通过微信或短信方式发送给老板和人事部门。
如果公司孤立员工，员工应积极调整心态，保持正常的工作状态。
工资与赔偿问题
无论员工何种原因离职，用人单位都应支付员工应得的工资。
如果员工自动离职给用人单位造成损失，用人单位可以要求员工赔偿经济损失。
法律途径
如果员工与公司无法协商解决离职问题，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。
用人单位在解除劳动合同时，应出具相关证明，并在规定时间内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
建议员工在面临自动离职情况时，保持冷静，合理应对，并尽可能收集并保留相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。同时，企业也应遵循相关法律规定，妥善处理员工离职事宜，避免因处理不当产生法律纠纷。